1. Koncentracija pufra
Koncentracija pufra TRIS lahko vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR. Na splošno so primerne koncentracije pufra TRIS med 10-100 mM. Če je koncentracija pufra prenizka, lahko povzroči nestabilen pH reakcijskega sistema, kar lahko vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR. Če je koncentracija pufra previsoka, lahko zavre aktivnost polimeraze, kar vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR.
2. pH pufra
Na učinkovitost in natančnost reakcije PCR vpliva tudi pH pufra TRIS. Na splošno je pH reakcije PCR med 8,0-8,8. Če je pH pufra prenizek, lahko pride do zmanjšanja aktivnosti polimeraze, kar lahko vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR. Če je pH pufra previsok, lahko pride do nepopolne denaturacije predloge DNA, kar lahko vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR.
3. Ionska moč pufra
Ionska moč pufra TRIS vpliva tudi na učinkovitost in natančnost reakcije PCR. Na splošno je ionska moč TRIS pufra med 50-150 mM. Če je ionska moč pufra prenizka, lahko povzroči nestabilne koncentracije ionov v reakcijskem sistemu, kar lahko vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR. Če je ionska moč pufra previsoka, lahko zavre aktivnost polimeraze, kar vpliva na učinkovitost in natančnost reakcije PCR.
